以下几种方法可以都试用一下，思路都差不多。
EXE文件关联被修改后，情形是很吓人的。某回给一个企业修理此类状况，公司财务吓得几乎面无人色，以为所有的东西都完蛋了。经我一番巧妙折腾，症状消失，才如释重负，狠狠的请了我一顿，那电脑里有公司所有重要的资料，要是丢了，麻烦大矣。
一、在安全模式下输入：assoc<空格>.exe=exefile<回车>，屏幕上将显示“.exe=exefile”。现在关闭命令提示符窗口，按Ctrl+Alt+Del组合键调出“Windows安全”窗口，按“关机”按钮后选择“重新启动”选项，按正常模式启动Windows后，所有的EXE文件都能正常运行了！
二、解决方法：
方法一：把regedit.exe改名为，然后执行，把HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\CLASSES\exefile\shell\open\command右边默认项的键值改为"%1"%*即可
方法二：（只适用于Win2000/XP）：
1、将cmd.exe改名为或cmd.scr。
2、运行
3、运行下面两个命令：
ftypeexefile="%1"%*
assoc.exe=exefile
4、将改回cmd.exe
方法三：当然是利用第三方工具了，如去下载瑞星的注册表修复器：
/zsgj/，利用它来修复一下文件关联。
三：EXE关联被修改后或者杀除病毒后，执行任何Exe文件都会出错或者要你选择运行程序，使系统软件不能正常运行，出现这种情况就要通过注册表来进行修复，但是注册表工具regedit.exe也是exe，也不例外的被禁止。
但一般病毒只会修改exe文件关联,并不会修改com文件关联.所以此时只要把regedit.exe复制一份到桌面，重命名为就可以按照以下的方法把被修改的键值改回来了.(regedit的具体位置在c:\windows\目录下)
如何让扩展名显示出来?
在Windows中默认是不显示扩展名的,这是为了防止用户在更改文件名时误操作把扩展名给改丢失了,如果扩展名丢失,则文件将变成不可识别的类型,也就是一般用户讲的坏了.如果需要更改文件扩展名,则必须让它显示出来,操作方法为:打开资源管理器>工具>文件夹选项>查看>高级设置>去掉不显示已经文件类型的扩展名前面的勾即可.
具体方法:
只要进入注册表到HKEY_CLASSES_ROOT>exefile>shell>open>command下面，把默认的值改为以下的值就可以啦
修改为:"%1"%*
或者直接新建一个注册表文件，直接导入，具体注册表文件内容为:
---------------------------------------------------------------------
WindowsRegistryEditorVersion5.00
[HKEY_CLASSES_ROOT\exefile\shell\open\command]
@="\"%1\"%*"
四：方法1:适用于所用Windows95以上版本的Windows(9x/ME/2000/XP/)
开始->运行->输入"command"(在Windows2000/XP/中，输入"cmd"，回车
在命令行中，依次执行以下命令：
cd%windir%
regedit
注册表编辑器打开后，找到以下分支：
HKEY_CLASSES_ROOT\exefile\shell\open\command
双击右侧窗口中的(默认)值，设置为"%1"%*[包含引号]
再找到:
HKEY_CLASSES_ROOT\.exe
双击右侧窗口中的(默认)值，设置为exefile
然后退出注册表编辑器，重启电脑
方法2：适用于Windows2000/XP/
开始->运行->输入"cmd"，回车
在命令行中，依次执行以下命令：
ftypeexefile="%1"%*[包含引号]
assoc.exe=exefile
重启电脑
方法3：适用于Windows2000/XP/
下载并运行以下任一.reg文件
http://www.kellys-korner-/regs_edits/exefix.reg
/xp/fileassoc/xp_exe_fix.zip
参考资料：/Article/system/systemtrouble/11/Article_1109.html
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