综合来看，个人认为直博难度更高一些，相对来说厉害一些，理由如下。
学习难度不同，直博的科研难度更深，硕博连读的学习难度稍低，而且直博对学生的科研要求也十分高，属于“不成功，便成仁”，若是直博学生承受不住学习的压力，那放弃也相当“前功尽弃”，只能获得本科学历，但硕博连读却并不会，即使放弃也能拥有硕士学位。
上岸难度也不同，硕博连读表面看似很难，但却没有直博难。学习本就讲究“循序渐进”，而直博却是跳过硕士学习直接读博，自然难度也会更高一些，再加上直博名额较少，基本都是双一流名校才有名额，难度也是“水涨船高”了。
学习年限有差距，若是直博学业顺利的话，那学生基本上5年就能够结束，而硕博连读则是5~6年，但也有的学生会延期毕业，直博延期毕业更是很普遍的情况，所以学生也要争取在有限的范围内顺利毕业，以免影响到自身的学历。
直博的福利待遇要稍高于硕博连读的学生，这也是很现实的问题，尤其是导师更加倾向直博学生，毕竟他们对科研的态度更加认真，并与导师有一定的科研默契，反观硕博连读的学生中途还面临着换导师。
毕业难度也不同，直博的要求更高，科研能力和个人心态也有着较高的标准，若是学生迟迟达不到学位的要求与标准，那毕业也会成为“未知数”，而这也意味着要付出双倍或更多的努力，才不至于让努力付诸东流。
个人感觉，能选硕博连读的尽量不要选择直博，毕竟光是毕业难度便让很多学生“望而却步”，但若是学生自身科研实力超高，那也可以努力挑战一下，毕竟越努力才能越优秀！
区别如下
1、选拔方式
直博：直博即本科生直接攻读博士学位，从校内外的优秀本科生当中进行选拔，能够在本科生阶段获得直博的资格都是佼佼者当中的佼佼者。
硕博连读：硕士生入学后，到第二年申请硕博连读，并获得通过后跳过硕士三年级，在硕士三年级的时候自动成为博士一年级。
2、学习年限
直博：直博生正常的学习年限是4-6年。
硕博连读：硕博连读的正常学习年限是2+3=5年。
3、占用名额
直博：直博只需要占用导师博士研究生的名额。
硕博连读：你是硕士的时候占用导师硕士的招生名额，成为博士的时候占用导师的博士名额。
直博和硕博连读都是殊途同归，学习年限差不多，最后同样获得博士学位证，直博的学生在本科期间的能力要比硕博连读的同学的能力更强，但是我们都是往前看，不是往后看。
实质上，直博并没有跳过硕士阶段。有的学校一般都会在直博阶段的某个时间（具体由学校而定）先颁发硕士学位的（不过有的学校的直博生是没有硕士学位的）。一般直博的时间会比硕士加博士的时间要短。
直博一般4-5年，硕博连读一般需要5年。招生单位一般鼓励学生提前毕业。经招生单位认定不宜继续攻读博士学位，可转为硕士研究生模式培养。
