三明市农业局调整了局农产品质量安全工作领导小组，成立了局农产品质量安全突发事件应急工作组，加强农产品质量安全监管工作。新设立农产品质量安全监督管理科，进一步理顺和明确了农产品质量安全归口管理科站以及相关科站和单位的职责，形成合力。同时，制定了《三明市农业局农产品质量安全监管工作制度》和《三明市农产品质量安全发展“十二五”规划》，印发新修订的《三明市重大食品事故应急预案农业部门操作手册》。
12个县（市、区）都成立了农产品质量安全工作领导小组，明确了归口管理股站。其中泰宁、明溪、宁化、将乐等四个县成立了县级农产品质量安全监督管理机构。泰宁、将乐、宁化、建宁、大田、沙县等六个县成立了乡镇农产品质量安全监管机构。
全市农产品质量安全检验检测体系不断健全，为农产品质量安全监管提供技术支撑。其中尤溪、永安、大田、宁化、沙县、将乐、泰宁、建宁和清流等9个县(市)实施农业部县级农产品质检站建设项目。
实施农产品质量安全可追溯试点工作，福建三明好多多农业发展有限公司、福建省源丰农业科技有限公司、福建旺丰生态农业发展有限公司等3家企业列入省级蔬菜瓜果可追溯建设试点企业。福建光华百斯特生态农牧发展有限公司列入省级畜产品质量安全可追溯建设试点企业。
市、县两级农业部门都成立了农业行政综合执法大队，形成“市有支队，县有大队”的农业行政综合执法格局，监管农业投入品。
