东皇钟的来历有两种说法：
第一种说法：东皇太一是太阳所孕育而出的生物，因怀抱着混沌钟出世，故又把混沌钟称为东皇钟。
相传在天地未开，一片混沌之际，盘古使用开天斧进行开天辟地的伟业。之后天地间的浊气下降，清气上升。盘古看天地过于萧条，于是把自己的双眼化作日月，皮毛化作草被树林，血液经脉化成河流山川。东皇太一因而从太阳中孕育了悠久的时间而出世，因怀抱着混沌钟出世，故又把混沌钟称为东皇钟。
第二种说法：鸿钧道祖曾在洪荒之时，收下三大亲传弟子，东皇太一就是其中之一。在鸿钧进行分宝崖分散宝物之时，东皇太一得到了东皇钟。
在盘古开天辟地后，东皇太一手持东皇钟开辟了天庭所在，自号天帝，并将东皇钟化作为天庭之门，以保卫天庭之用。在之后的巫妖大战之中，东皇太一手持东皇钟，使用两大混沌阵法与巫族相缠斗。后因两方大战不可开交，东皇太一故有东皇钟也被祖巫玄冥拖入同归于尽的下场。东皇钟也自此下落不明，楚国屈原也因此而作了九歌《东皇太一》。
