鸡鸣寺药师佛塔是应佛教界知名人士倡议，经有关部门批准，于1988年春在中国南京市古石头城边鸡鸣寺兴建起来的一座药师佛塔。
历时两年，1990年春正式落成。全称为“南京鸡鸣寺药师佛塔”。乘坐地铁3号线到鸡鸣寺站 （5口出）下车步行960米到达药师塔。
因为是后门，所以一出来就是鸡鸣寺的最高点——药师佛塔，它是1991年新建的七层八面佛塔，是鸡鸣寺历史上的第五座大佛塔。塔高约44.8米，外观为假九面，实为七级八面，斗拱重檐，铜刹筒瓦。
塔内供奉有药师佛铜佛像一座，此像原供奉于北京雍和宫，1972年由赵朴初向国务院提请、经周总理批准送给南京灵谷寺，灵谷寺维修时，将该佛像暂存市文管会，宝塔建成后，又从文管会迎奉于塔内。
塔内每层中间还有四个佛龛，为明代金丝楠木雕，原为北京中南海旧物，每个龛内供奉有一尊捕木的药师佛像，共24尊。 不知道是维修还是不准上去，反正塔门是关着的，只能在底下转转。围着塔底有很多人在祈愿，还可以敲钟祈福，香火还是挺旺的。
药师塔在鸡鸣寺里面，在台城上看药师塔倒是构成了金陵特有的风景，而且当年拍新白娘子传奇中的雷峰塔实际上是取景药师塔的，所以大家在电视剧里面看的雷峰塔实际上是南京鸡鸣寺里面的药师塔。
