尿素适于作基肥和追肥，一般不作种肥。因为高浓度的尿素会破坏蛋白质的结构，使蛋白质变质，影响种子发芽和幼苗根系生长，严重时会使种子失去发芽能力。尿素使化学肥料，宜用于地温较高的土壤环境，否则会降低地温，影响根系的生长发育。
1、秋季施用
旱地尿素秋施较春施效果好。在相同条件下，据试验秋施可以使尿素当季利用率比春施提高10.8％以上，如果配合有机肥和其它化肥，效果更好。
2、根外追肥
尿素使酰胺态肥料，是有机物，中性，不含副成分，不易对枝叶造成灼伤；尿素分子体积小，易于透过细胞膜进入细胞，尿素本身有吸湿性，容易被叶片吸收，尿素往叶内透入时，不易引起质壁分离，即使发生也会很快恢复，所以尿素作根外追肥比其它氮素肥料好。根外喷施浓度、时间随作物种类不同而不同。一般每亩每次用尿素0.5－2.5千克，每4－5天一次，2－3次即可。
3、深施覆土
尿素施入土壤，先经土壤微生物作用，水解为碳酸铵或碳酸氢铵，方可被作物根系吸收。碳酸铵很不稳定，在土壤中或土壤表面分解形成游离氨，易挥发损失，所以尿素也要深施覆土，覆土深度一般10厘米左右。
4、阴天或雨后施用
尿素吸湿性能好，旱地追肥尽量在雨后，以便肥料迅速溶解，被土壤吸附。而且温度低，不易使氨挥发。同时叶可以使部分肥料通过叶片吸收，提高肥效，减少损失。
5、早晨或傍晚使用
不要在阳光直射的中午施用，否则会使碳酸铵或碳酸氢铵的分解生成氨气，使叶部受害，引发肥害。
6、配合其他肥料施用
尿素属于单元肥料，施用时应和磷肥或其它化肥配合使用，这样既可以满足作物对各种养分的需要，同时也能发挥肥料之间的协助作用。
7、尿素和有机肥配合使用
尿素和有机肥料施用时提高尿素肥效的有效措施，可以取长补短、缓急相济；提高肥效，节约化肥；促进微生物活动，改善作物营养条件；降低生产成本，提高产量，增加收入等，从而提高肥料的利用率和经济效益。
