这个问题有个最简单的逻辑，鸣人是主角，当然不能死啦！哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈！
好吧，严谨一点，从剧情来解读一下。
大蛇丸的目的是佐助的身体。大蛇丸研究成功了转生术，需要年轻有潜力的身体来作为他的容器，而佐助就是他的目标。死亡森林，大蛇丸给佐助留下咒印，让三名音忍去刺杀佐助，都是为了测试佐助的实力。
杀掉鸣人会破坏大蛇丸的计划。当时的鸣人虽然很碍事，但本质上并没有对大蛇丸多去佐助的计划造成影响，不用杀了他。鸣人对木叶的重要性不言而喻，如果大蛇丸杀了鸣人，只会引起木叶的反应，只怕到时他很难离开木叶。
大蛇丸估计杀不了鸣人。火影中鸣人很多时候遇到危险，九尾都会挺身而出救下鸣人。如果大蛇丸对鸣人出手，九尾同样不会坐视不管，只怕大蛇丸自己会偷鸡不成蚀把米了。
