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内镜下第三脑室底造瘘术（Endoscopic third ventriculostomy，ETV）
近年来，医生对使用内镜方法治疗脑积水的兴趣大增。原先对分流手术的乐观态度有几分减退。分流系统是容易惹麻烦的装置，据文献报道脑室-腹腔分流并发症的发生率高达40–60%。最可怕的并发症是分流失败，可导致严重的神经功能减退，甚至因脑积水死亡。这在发展中国家儿童更需要特别关注，因为这些病人居住远离有条件修正分流失败的医疗中心。这个观点被临床医生广泛接受，因此，非洲撒哈拉沙漠以南儿童接受ETV和双侧脉络丛电灼术治疗。该项研究以及其它研究使医生对ETV治疗各种病因导致脑积水的兴趣大增，甚至包括发达国家医生。采用新的神经内镜观察脑室解剖格外清晰。将神经内镜和导航系统联合使用，将脑室的手术的危险性显着减少。
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脑室内病变活检和切除术
医生对于采用新的内镜技术进行更为复杂的脑室内手术的兴趣也呈爆发性增加。这些手术包括不同肿瘤的活检术，比如松果体区肿瘤和其它外生性肿瘤。因为许多这些肿瘤患者还发生脑积水，同时进行ETV和肿瘤活检术的病例在增加。同样，对于脑室内质地较软并且易碎的肿瘤采用内镜下切除的兴趣增加，因为，这个技术对病人脑皮层结构产生的损伤更小。
内镜技术还是切除胶样囊肿有用的工具。虽然穹窿间和经皮层入路广受欢迎，对比研究显示内镜下经脑室入路较开放手术术后住院时间缩短、并发症发生率低。在尸体模型研究显示，杏仁核海马切开术可以通过枕部钻孔入路完成，功能性大脑半球切除术可以通过旁矢状面钻孔完成。
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经蝶窦手术
鼻内经蝶窦入路到达鞍区和鞍旁结构很早就发现，起始于古代埃及人制作木乃伊过程中的去脑术。在Harvey Cushing放弃使该入路后，使其重新获得新生的先驱是另一位巨匠——法国神经外科医生Gerard Guiot。他被称为Cushing的“精神徒孙”，因为他首先作为Clovis Vincent的助手学习经蝶窦入路到达鞍区手术，而Vincent在二十世纪代向Cushing学习了许多这些技术。Guiot还在爱丁堡皇家医院访问2个星期，观察了另外一位Cushing以前的学生Nornan Dott做手术。Guiot是第一个使用独立光源和内镜做神经内镜手术的医生，尽管他因为内镜和外鞘体积过大而以后放弃了。
耳鼻喉科医生首先采用内镜技术检查和进行鼻窦手术，甚至有些垂体手术。相当长一段时间，医生采用显微镜进行经蝶窦手术
，因为觉得显微镜在这狭窄而又拥挤的通道上提供更好的可视性、3D图像和更安全的手术。然而，象Jho和Laws这样的神经外科医生展示了内镜可以作为垂体手术主要的工具。通过神经导航和3D技术进一步改进，可以让外科医生空前地看清鞍旁和鞍区重要结构。实际上，随着显微手术能力和技术的提高，扩大经蝶入路能够显露从颈椎到嗅球、侧方到达卵圆孔区域。
神经内镜的演化历史悠久，进程时有断续。这个领域充满传奇色彩的人物，比如Bozzini和Harold Hopkins。它是由临床医生、工程师和科学家合作的结晶，这样长期的合作必将带来神经内镜新的应用。
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