对于现在的日本人的起源在日本主要有两派人，一派认为日本人是徐福的后代，另一派认为他们是秦始皇的直系后代，不管是那一派都认为日本人是在秦始皇那个时候来到这里。
第一种说法：徐福等人带领三千童男童女入海求仙药，后来不知所终，有传说是到了日本，后来在那“生根发芽”，有了现在的日本人。
第二种说法：秦始皇死后，残暴无度的胡亥，肆意残杀宗族，导致秦始皇其他的儿子、孙子逃离皇宫，登船来到了日本岛，并在这里定居，繁衍，最后还建立的自己的国家。
然而这两种说法并不能成立，在我国周朝文献《海内北经》记有：“盖国在钜燕南，倭北。倭属燕。”倭则是日本人在古代中国的一个称呼，说明在那个时期日本人就已经有了土着人种。
近年来有人用DNA 检测，但是日本人的DNA不仅仅十分的难懂，而且是十分的混乱，好像是很多很多的人种的混血。但这样的真相却让日本人无法接受现实。
